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Accès aux données

 

Où vont-les données ? Comment communique-t-on les résultats scientifiques ? Quelle protection des données personnelles ? 

Objectifs

Les données collectées dans le cadre des observatoires de Vigie-Nature sont destinées à la connaissance de la biodiversité, à la documentation de l’état de conservation des espèces et à la recherche. Elles peuvent être mobilisées pour différentes thématiques scientifiques, en particulier la biologie de la conservation, mais aussi un large éventail de recherches fondamentales ou appliquées, allant de l’écologie des communautés à la psychologie, et de l’aménagement urbain aux liens entre diversité phylogénétique et changements globaux.

Les données ne doivent pas être utilisées pour localiser des sites à des fins de prélèvement ou d’exploitation des ressources naturelles.

Aims

Data collected in the framework of Vigie-Nature schemes are meant to be used to increase knowledge on biodiversity, to document species conservation state and for research. They may be used for several themes, conservation biology on the first hand, but also a large array of fundamental or applied researches, from community ecology to psychology, and from urban planning to interactions between phylogenetic diversity and global change.

These data should not be used to localize sites in order to collect or exploit natural resources.

DONNEES VIGIE-NATURE

Structure des données de sciences participatives des programmes Vigie-Nature

Les données de sciences participatives collectées dans le cadre de Vigie-Nature consistent 

  1. en données standardisées d’observations, celles-ci pouvant être déclaratives (espèce observée, quantité, distance, …) ou numériques (photos, enregistrements, …),

en données de contexte, décrivant les conditions dans lesquelles les données d’observations ont été collectées (météo, milieux, observateur, numéro de passage, …) et

  1. en métadonnées (stratégie d’échantillonnage, référentiels utilisés, …).

 

A titre d’exemple, voici les données disponibles dans le cas du protocole SPIPOLL-Flash, toutes les informations suivantes étant réunies dans une seule table :

URL de chacune des photos, taxon(s) associé(s) par le participant, propositions des autres participants et validation retenue par l’expert s’il y a lieu, taxon vu sur la fleur ou non, effectif (par classes),

URL de la photo de la plante et de la photo du paysage, coordonnées géographiques  (EPSG 3857 WGS 84), plante à l’ombre ou non, spontanée ou plantée, distance à la ruche la plus proche si connue, présence d’une grande culture en fleurs, type d’occupation du sol (par classes), vent (par classes), ensoleillement (par classes), température (par classes), date, heure de début, heure de fin,

  1. Stratégie d’échantillonnage, classes diverses, liste des taxons avec affiliations par grands groupes

 

Accès aux données. L’extraction et la fourniture de données peuvent être coûteuse en temps comme en ressources humaines. En conséquence, tout n’est pas possible :

  • ce que l’équipe fait : envoi de fichier plats (.txt ou csv., UTF8) de toutes les colonnes, non ordonnées et non triées
  • ce que l’équipe ne fait pas : fichiers à demande (colonnes ordonnées, triées) et à façon (sélection des colonnes et filtres sur les données), formats d’envoi spécifiques (multi-tables, formats propriétaires)

 

Vigie-Nature citizen sciences programs’ data structure

Citizen sciences’ data gathered in the framework of Vigie-Nature are of three distinct types :

  1. standardised observation data, numeric (pictures, recordings, …) or declarative

environmental data such as weather conditions, participant ID, habitat, …

  1. metadata such as sampling strategy, referentials and dictionaries, …

 

For example, here is a description of what one would get from SPIPOLL-Flash data request, all these data being provided within one single data table :

  1. insect pictures URLs, identification as given by the participant, identification suggestions from other participants, expert validation if any, whether or not the insect was seen on the flower, class of abundance 
  2. plant pictures URLs, surroundings picture URL, geographical coordinates (EPSG 3857 WGS 84), shade condition, ornamental/indigenous plant, distance to closest hive if known, presence of blooming crop within 50m, habitat class, wind class, sunshine class, temperature class (C°), date, starting time, ending time,
  3. sampling strategy, details of classes, taxa list 

 

Data access can be very costly. Thus, our general policy is as follows:

  • What Vigie-Nature team can do : provide flat files in .txt or .csv formats with all columns neither ordered nor sorted
  • What Vigie-Nature team does not do : special requests regarding sorting, filtering or ordering columns, multi-table datasets, proprietary file formats

 

Données personnelles

Les participants aux programmes Vigie-Nature s’identifient lors de leur inscription sur les sites de participation. Les données personnelles des participants, noms, prénoms, mails, adresses ou tout autre informations personnelles ne sont pas communiquées sans l’accord préalable de chacun des participants. 

Personal data

Vigie-Nature participants are identified when they register on the website. Personal data, name, surname, addresses or any personal information are not shared without express permission from each individual participant.

ENGAGEMENTS

Remerciements aux observateurs 

Les jeux de données Vigie-Nature reposent sur l’implication et les efforts du réseau d’observateurs volontaires qui récoltent chaque année les données sur le terrain.

Nous demandons à ce que chaque document produit à partir de l’analyse des données (article, rapport, bulletin, etc.), mentionne et remercie l’ensemble des volontaires ayant rendu les suivis possibles. Merci de mentionner également Vigie-Nature et l’association porteuse qui assurent le développement et la coordination de l’observatoire.

Acknowledging participants

Vigie-Nature database are crucially dependent of volunteers implication and effort to collect field data year after year.
We request that all produced documents using Vigie-Nature data (articles, reports, newsletters, etc.) mention and thank all the volunteers who have made the project possible. We also request that Vigie-Nature and the supporting NGOs are acknowledged for developing and managing the program.

Transmission des résultats

La communication avec les participants sur les résultats et les objectifs des programmes de science participative est d'une importance primordiale pour leur réussite.

Nous demandons aux utilisateurs de données de bien vouloir tenir informer l’équipe Vigie-Nature des avancements de la recherche scientifique (dates soutenances, conférences).

En cas de publication des résultats nous demandons aux utilisateurs des données de faire parvenir un pdf de la publication ainsi qu’un texte vulgarisé de 500 mots (dans le mois suivant la publication, en Français si possible ou à défaut en anglais). Cela permettra de faire un retour aux observateurs sur l’utilisation qui est faite de leurs données.

Si les auteurs souhaitent profiter d’un communiqué de presse du MNHN ils devront avertir l’équipe au moins 1 mois avant la date de publication. Un comité d’évaluation au MNHN se réunira pour étudier la demande.

Transmission of results

Communication with participants on results, issues and objectives of the monitoring schemes is of prime importance if these are to be successful. 

We request that people using Vigie-Nature should kindly keep the Vigie-Nature team informed of the progress of the scientific research (PhD defense, conferences).

In case of publication of the results, a pdf of the publication, as well as a popularized text of 500 words, should be provided for Vigie-Nature team in the month following the publication, preferably in French, otherwise in English). This will allow to give feedback to observers on how their data are being used.

If the authors wish to take advantage of press release from the MNHN, they will have to notify the team at least 1 month before the publication date. An evaluation committee at the MNHN will assess the request.

FORMULAIRE de demande de données

 https://framaforms.org/demande-de-donnees-issues-du-programme-vigie-nature-1524124340

CITATIONS STANDARD

[ Tous les documents reposant sur une utilisation des données de l’un des observatoires de Vigie-Nature (articles, rapports, communications), devront mentionner le projet à travers l’utilisation de la citation standard correspondante. ]

Scolaires

Vigie-Nature-Ecole (201x).  Base de données du Suivi participatif Vigie-Nature-Ecole / School citizen science project database for France. Muséum national d’Histoire naturelle, Paris, France. 

Gestionnaires

Florilèges-prairies urbaines - Vigie-Nature (année de consultation des données).  Base de données de Florilèges-prairies urbaines. Département de la Seine-Saint-Denis, Agence régionale de la biodiversité en Île-de-France, Conservatoire botanique national du Bassin parisien, Plante & Cité, Muséum national d’Histoire naturelle, France. 

Propage - Vigie-Nature (année de consultation des données).  Base de données de Propage. Noé, Muséum national d’Histoire naturelle, France. 

Grand Public

Sauvages de ma rue - Vigie-Nature (année de consultation des données).  Base de données du Suivi participatif Sauvages de ma rue / Urban plant citizen science project database for France. Tela Botanica - Muséum national d’Histoire naturelle, Paris, France.

Spipoll - Vigie-Nature (année de consultation des données).  Base de données du Suivi photographique des insectes pollinisateurs / Photomonitoring of pollinating insects database for France. Office pour les Insectes et leur Environnement - Muséum national d’Histoire naturelle, Paris, France.

Opération Papillons - Vigie-Nature (année de consultation des données).  Base de données de l’Opération Papillons / Butterfly citizen science project database for France. Noé - Muséum national d’Histoire naturelle, Paris, France.

Opération Escargots - Vigie-Nature (année de consultation des données).  Base de données de l’Opération Escargots / Snail citizen science project database for France. Noé - Muséum national d’Histoire naturelle, Paris, France. 

Observatoire des Bourdons - Vigie-Nature (année de consultation des données).  Base de données de l’Observatoire des Bourdons / Bumblebees citizen science project database for France. Groupe Associatif Estuaire - Muséum national d’Histoire naturelle, Paris, France. 

Oiseaux des Jardins - Vigie-Nature (année de consultation des données).  Base de données du Suivi participatif Oiseaux des Jardins / Common birds citizen science project database for France. Ligue de Protection des Oiseaux - Muséum national d’Histoire naturelle, Paris, France. 

Naturalistes

STOC EPS - Vigie-Nature (année de consultation des données).  Base de données du Suivi Temporel des Oiseaux Communs / Common Bird Monitoring Scheme database for France. Muséum national d’Histoire naturelle, Paris, France.

SHOC - Vigie-Nature (année de consultation des données).  Base de données du Suivi Hivernal des Oiseaux Communs / Winter Bird Monitoring Scheme database for France. Muséum national d’Histoire naturelle, Paris, France.

STERF - Vigie-Nature (année de consultation des données).  Base de données du Suivi Temporel des Rhopalocères de France / Butterfly Monitoring Scheme database for France. Muséum national d’Histoire naturelle, Paris, France.

STELI - Vigie-Nature (année de consultation des données).  Base de données du Suivi Temporel des Libellules de France / Dragonfly Monitoring Scheme database for France. Muséum national d’Histoire naturelle, Paris, France.

Vigie-Chiro - Vigie-Nature (année de consultation des données).  Base de données du programme de suivi participatif des Chauves-souris de France / Bat Monitoring Scheme for France. Muséum national d’Histoire naturelle, Paris, France.

Vigie-Flore - Vigie-Nature (année de consultation des données).  Base de données du programme de suivi participatif des plantes vasculaires de France / Vascular Plants Monitoring Scheme for France. Muséum national d’Histoire naturelle, Paris, France.

Agriculteurs

Observatoire Agricole de la Biodiversité (année de consultation des données).  Base de données de l’Observatoire Agricole de la Biodiversité / The Agricultural Biodiversity Observatory of France. Ministère en charge de l’Agriculture - Assemblée Permanente des Chambres d’Agriculture - Université de Rennes 1 - Muséum national d’Histoire naturelle, Paris, France.